O projeto de proteção de riachos e nascentes envolve a recuperação da mata ciliar devastada na margem e afluentes paraguaios do reservatório.

A Itaipu cadastra, orienta e auxilia os produtores rurais paraguaios a produzir mudas, transplantar as mudas produzidas para a mata ciliar e acelerar os procedimentos de regeneração natural.

A manutenção da mata ciliar é uma das exigências para a obtenção da licença ambiental para a exploração da propriedade rural com agropecuária.

Segundo a legislação florestal paraguaia, é necessária a preservação de uma faixa de 100 metros de largura da cobertura florestal em cada lado do curso de água, que funciona como um filtro para reter o solo e minimizar a contaminação da água com a contenção de escorrimentos carregados de resíduos tóxicos, especialmente agroquímicos.