Um dos objetivos principais do trabalho desenvolvido pelo sub-programa Carapá Ypoti é a preservação do lago da Itaipu. As ações estão sendo realizadas para conservar e recuperar a mata de proteção vegetal do reservatório, as chamadas áreas protegidas, demarcadas por uma linha poligonal abrangente.

Observa-se atualmente que grandes e pequenos proprietários rurais estenderam suas áreas de cultivo e invadiram o patrimônio conservado pela Itaipu. Muitas vezes a invasão é consciente e proposital, ou seja, o produtor conhece o limite de sua propriedade e retira os pilares que delimitam a área da Itaipu para expandir o cultivo.

A primeira atividade é realizar um diagnóstico da situação dos pilares. E logo se busca um entendimento com os invasores para realizar o reflorestamento e assim promover a recuperação da área patrimonial da Itaipu.