Los gobiernos de Paraguay y de Brasil tienen la atribución de designar la Dirección Ejecutiva de la Itaipu Binacional, por medio de la Administración Nacional de Electricidad (ANDE) o de la Eletrobrás. Para cada cargo reservado a un país, hay un puesto equivalente destinado a la otra margen.
La Dirección Ejecutiva está compuesta por los siguientes cargos: Director General Paraguayo; Director General Brasileño; Director Técnico Ejecutivo; Director Técnico; Director Financiero Ejecutivo; Director Financiero; Director Jurídico Ejecutivo; Director Jurídico; Director de Coordinación Ejecutivo; Director de Coordinación; Director Administrativo Ejecutivo; y Director Administrativo.
Además de la Dirección Ejecutiva, la Itaipu tiene un Consejo de Administración compuesto por doce Consejeros, seis paraguayos y seis brasileños, y dos representantes de los Ministerios de Relaciones Exteriores, uno de cada país. El Consejo de Administración se reúne cada dos meses o por convocatoria extraordinaria.
En la margen paraguaya, tres nombres son señalados por el gobierno nacional, dos por la ANDE y uno por el Ministerio de Relaciones Exteriores. En Brasil tres indicaciones caben al gobierno federal, dos a la Eletrobrás y una al Ministerio de Relaciones Exteriores. Los Consejeros tienen mandato de cuatro años, y los Directores de cinco años.
La Dirección Ejecutiva cumple el régimen interno y el Tratado de Itaipu; conduce asuntos de la entidad; y propone al Consejo de Administración a las directrices y normas de administración, entre otras atribuciones. El Consejo de Administración hace cumplir el Tratado de Itaipu y sus anexos.
Las atribuciones del Consejo de Administración, entre otras, son definir las directrices fundamentales de la administración de la empresa y su régimen interno; aprobar el presupuesto para cada ejercicio; y examinar el informe anual.
Consejo de Administración
| Consejero - Paraguay | Orlando Pessuti |
| Consejero - Paraguay | Osvaldo Román Romei |
| Consejero - Paraguay | Roger Balbi Balbuena Sanchez |
| Consejero - Paraguay | Paulo Bernardo Reichardt |
| Consejero - Paraguay | Mirtha Vergara de Franco |
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Consejero - Paraguay |
Jose Maria Cardozo Saguier |
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Consejero - Paraguay,
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Carlos Dionisio Heisele Sosa |
| Consejero - Brasil | Celso Luiz Nunes Amorim |
| Consejero - Brasil | Alceu de Deus Collares |
| Consejero - Brasil | Luiz Pinguelli Rosa |
| Consejero - Brasil | João Vaccari Neto |
| Consejero - Brasil | Roberto Átila Amaral Vieira |
| Consejero - Brasil, Presidente de ELECTROBRAS |
José Antonio Muniz Lopes |
| Representante del Ministerio de Relaciones Exteriores de Brasil |
Antonio José Ferreira Simões |
Dirección Ejecutiva
| Director General Paraguayo | Franklin R. Boccia Romañach |
| Director General Brasileño | Jorge Miguel Samek |
| Director Técnico | José Maria Sánchez Tilleria |
| Director Jurídico Ejecutivo | Eusebio Ramón Ayala Giménez |
| Director Jurídico | Cezar Eduardo Ziliotto |
| Director Administrativo Ejecutivo | Alberto Magno Ricardo González |
| Director Administrativo | Edésio Franco Passos |
| Directora Financiera Ejecutiva | Margaret Mussoi Luchetta Groff |
| Director Financiero | Uvaldino Javier Galeano Benítez |
| Director de Coordinación Ejecutivo | Sady María Aranda |
| Director de Coordinación | Nelton Miguel Friedrich |
Secretarías
Secretaría del Consejo de Administración - Paraguay
Nathaly Zaván 00-595-21-248-1416 Asunción
Secretaría de la Dirección Ejecutiva
Carolina María Uriarte de Ortigoza 00-595-21-248-1698 Asunción
Secretaría del Consejo de Administración - Brasil
Edith de Souza Silva 0055-41-3321-4411 Curitiba
Secretaría de la Dirección Ejecutiva
Marcos Antonio Teixeira da Silva 0055-45-3520-5252 Foz do Iguaçu
