El sistema de transmisión de ITAIPU conecta tres subestaciones situadas dentro de la Central (dos subestaciones aisladas a gas, una de 50 Hz y otra de 60 Hz, instaladas dentro de la Casa de Máquinas, y una convencional de 50 Hz en la Margen Derecha) con los Sistemas Interconectados paraguayo y brasileño.

A partir de 2014, en el sector de 50 Hz se pasó de seis a ocho líneas de transmisión en 500 kV, siendo cuatro entre la Casa de Máquinas y la Subestación Margen Derecha, con alrededor de dos km de extensión, y cuatro entre las Subestaciones Margen Derecha y Foz do Iguaçu, con cerca de 9 km. En el sector de 60 Hz son cuatro líneas de transmisión de 500 kV, cada una con alrededor de 10 km, que conectan la Planta con la Subestación Foz do Iguaçu.